Në përputhje me punën e  Q.SH.P. dhe ligjin për mbrojtjen e popullatës nga sëmundjet infektive, dhe në trend me diagnostifikimin laboratorik modern në repartin funksionojnë laboratorët e mëposhtme: 

 I  -   Laboratorët për infeksionet e frymëmarrjes – 

Shqyrtimi mikrobiologjik dhe mykologjik të brisit nga fyti, hunda, sytë, veshët, plagët, ekzaminimin e pështymës, hemokulturë, testimin e sterilizimit të aparatit,sekrecionet, ekskrecionet etj. 

Nga materiali indetifikohen: Staphulococcus, Moraxhella, Haemophilus, SPP. E.Coli, Pseudomonas spp., Proteus spp., Streptococcus pneumoniae, Phiogenes Streptococcus ( dhe shtypja), Staphulococcus të epidemis me antibiogram dhe etj.  

Dëshmon pranin e Candida albicans dhe Candida spp.  

 Dëshmon saktësin e sterilizuar me sporet e B.subtilis, dhe G. Stearothermophilus

II -  Laboratori për analiza serologjike – gjak, brise dhe analiza:

• demonstrim imunofluoreshent të brisit nga trakti urinogjenital, sytë (dëshmimin e pranishëm të trachomatis Chlamdia)  
•  pneumoslajd IGG dhe IGM   Kapiteni brucellës – provë për të dëshmuar Brucelli
• Diagnostifikimin e Helicobacter në gjak me aparat Vidas Min
  R.P.R.Т.P.H.А. -  test për Suphilis
• Sëmundjet reumatike :                 

• §Me aparat Minineph CRP, ASO, RF. 
• §ASO LATEDZH TEST KIT  
• §RF LATEDZH TEST KIT  
• §CRP LATEDZH TEST KIT  

III -   Laboratori për infeksionet urogjenitale -

Ekzaminimet mikrobiologjike dhe mykologjike të urinokulturës, vaginale, bris nga qafa e mitrës, brise uretrale, të spermokulturës. 

Dëshmia në urinën e izolateve Gram negative dhe Gram pozitive me antibiograme  

(Metoda disk)

Dëshmimin e pranishëm të Candida albicans në urinokultura, vaginale, brise nga qafa e mitrës dhe uretrale dhe spermokultura.  

Dëshmon pranin e baktereve patogjene në briset vaginale, të qafës së mitrës dhe uretrale dhe spermokulturës.   

Shqyrtimi i Mycoplazmës dhe Ureoplazmës në briset e qafës së mitrës dhe uretrale.  

IV-  Laboratori për parazitologji  

 Ekzaminimi Parazitologjisë të shërbimit dhe bris perianal, helminti urines dhe protozoa,

 Filarija, Schistosomes dhe malaria.

 Shqyrtimin fekal për virusin Rota.   

Laboratori për infeksione enteropatogjene -     

 Ekzaminim mikrobiologjik dhe mykologjik të fekaleve, shqyrtimin e baktereve - Salmonella  

 Shigella, Enteropatogena, E. Coli, Campylobacter etj.  

V -  REPARTI SANITAR:

Laboratori për ujë – analiza bakteriologjike të ujit nga ujësjllësit e qytetit objektet ujë-furnizuesë publik dhe individual pas kërkesës së palëve , pishin, ujrave sipërfaqësore, liqene etj.  

Laboratori për ushqim 

 Analizat bakteriologjike të produkteve nga prodhimi dhe tregtia, me urdhërin e inspektimit dhe pas kërkesës së palëve  

 Analizat mikrobiologjike të briseve nga sipërfaqet e punës,pastrimin e duarve dhe shqyrtimin e pranishëm të bakterieve në ajër, në organizata industriale dhe punuese, objekte spitalore  etj.   

 Reparti mikrobiologjik për kryerjen e detyrave të tyre posedon paisje dhe aparate të kompjuterizuara moderne.  

- publikimi i rezultateve është e kompjuterizuar dhe jepen standarde referuese.